Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 ZNF268-212ENST00000542711 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 AL583722.3-201ENST00000553433 503 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 AC015818.3-201ENST00000583797 589 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 MXRA7-204ENST00000585519 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 Metazoa_SRP.141-201ENST00000615072 282 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 AC005906.2-208ENST00000638655 1286 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 CD9-212ENST00000610354 1315 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 ECHDC2-201ENST00000358358 1126 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 AL133351.2-201ENST00000437718 484 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 SCGB1A1-202ENST00000534397 466 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 HNRNPA1P11-201ENST00000580106 956 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 AC022382.1-201ENST00000602768 336 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 AC008555.6-201ENST00000605047 458 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 AC010601.2-201ENST00000623060 774 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 SLIRP-201ENST00000238688 394 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 HMGN1P4-201ENST00000419500 290 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 GAPDHP29-201ENST00000429913 985 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 AC004895.1-202ENST00000435547 547 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 H1FOO-202ENST00000503977 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 AC008808.2-201ENST00000510349 569 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 AC116552.1-201ENST00000563243 733 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 AC100778.4-201ENST00000581232 582 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 NSRP1-213ENST00000584423 482 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 AP001120.3-201ENST00000585729 489 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 AP006248.1-201ENST00000610471 67 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 AC127002.1-201ENST00000619123 455 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 AC245427.1-201ENST00000633705 760 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 CCDC175-201ENST00000281581 2487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 ASMT-203ENST00000381241 1388 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 AC005519.2-201ENST00000554532 1367 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 RIN2-202ENST00000440354 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 FAM27E3-201ENST00000418795 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 HRASLS2-201ENST00000255695 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 AL358876.2-201ENST00000424689 477 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 Z84721.1-201ENST00000438841 372 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 AC022634.2-201ENST00000521504 382 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 MIR4539-201ENST00000579784 60 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 AC025048.4-201ENST00000589740 699 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 AC048380.1-201ENST00000589818 465 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 AC092634.5-206ENST00000593670 812 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 AL139220.2-222ENST00000627999 756 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 DUX4L33-201ENST00000635217 958 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 ENSA-208ENST00000369014 2085 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 LIMS1-204ENST00000409441 1627 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 GFI1B-202ENST00000372122 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 LYG2-201ENST00000333017 862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 S100A6-202ENST00000368720 673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 NPPB-201ENST00000376468 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 BTF3-202ENST00000380591 1237 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 PRDX3P2-201ENST00000447051 611 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 HAX1-211ENST00000532105 771 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 AC245369.8-201ENST00000636589 306 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 AC012158.1-201ENST00000535684 1366 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCA4P51532 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms