Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 MIER2-201ENST00000264819 6884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AL354919.1-201ENST00000453837 2257 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 SLC25A25-203ENST00000373068 3431 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 MYO9B-201ENST00000397274 7532 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 SP3-201ENST00000310015 6359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 SYMPK-214ENST00000599814 6537 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 LAIR1-204ENST00000391743 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 OGFR-202ENST00000370461 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms