Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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HOXA3O43365 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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HOXA3O43365 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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HOXA3O43365 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC11.46□□□□□ -0.57
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HOXA3O43365 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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HOXA3O43365 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
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HOXA3O43365 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
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