Protein–RNA interactions for Protein: A2RTX5

TARSL2, Probable threonine--tRNA ligase 2, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARSL2A2RTX5 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TARSL2A2RTX5 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms