Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 HNRNPC-221ENST00000555883 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 GRAPL-204ENST00000577213 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC100786.1-201ENST00000583018 513 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC087072.1-201ENST00000603727 421 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 MFSD12-215ENST00000615613 688 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 MEIS2-215ENST00000559561 1442 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 MRPS9-201ENST00000258455 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRIML2-207ENST00000512729 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADRA1A-210ENST00000519229 1838 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 VPREB3-201ENST00000248948 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC35F2-201ENST00000375682 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 VPREB3-202ENST00000398465 503 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC103563.2-201ENST00000442200 597 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAB11B-205ENST00000601897 577 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADCK1-201ENST00000238561 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 TTC23L-203ENST00000505624 1353 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 MRFAP1L1-201ENST00000320848 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 AK6-202ENST00000380822 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 CREB5-202ENST00000396298 2001 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 STT3A-211ENST00000529196 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 FXYD2-202ENST00000292079 571 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 SH3BGRL3-202ENST00000319041 768 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR339-201ENST00000362153 94 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM178B-201ENST00000393526 1004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 Z82185.1-201ENST00000417792 549 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 DUX4L31-201ENST00000446466 1136 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 TULP3P1-202ENST00000453253 1291 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 HAND2-AS1-208ENST00000504740 837 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC090200.1-201ENST00000522918 590 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL445363.2-201ENST00000554608 837 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 DLX6-203ENST00000555308 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL445363.1-201ENST00000623749 952 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 DUX4L33-201ENST00000635217 958 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 CA6-205ENST00000480186 1493 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANXA3-202ENST00000503570 1524 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 MCF2L-209ENST00000397036 1544 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SKP255-201ENST00000363442 313 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SKP203-201ENST00000363618 332 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SKP71-201ENST00000364558 318 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 7SK.1-201ENST00000365328 331 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC108879.1-201ENST00000438026 828 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC114781.1-201ENST00000450559 1028 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 KCNC4-AS1-201ENST00000455967 748 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC073896.3-201ENST00000546789 437 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC006262.2-202ENST00000600152 333 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL513478.2-202ENST00000621949 835 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 CNBP-207ENST00000502976 1626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 MBOAT4-201ENST00000320542 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM83A-AS1-202ENST00000520576 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZWINT-202ENST00000361148 807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
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