Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms