Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 IGSF9-201ENST00000361509 3996 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 AMACR-201ENST00000335606 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 LGALS8-208ENST00000416919 6097 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 VPS52-218ENST00000482399 3338 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 ZIK1-202ENST00000536878 4144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 FBXW11-201ENST00000265094 4342 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 ABL2-207ENST00000507173 3177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC3A1-205ENST00000409387 2334 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 KCTD10-201ENST00000228495 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 FUBP1-202ENST00000370767 2524 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 SYTL2-206ENST00000389960 4299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 KLLN-201ENST00000445946 4277 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 PTPRS-201ENST00000262963 4766 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 PTPRS-210ENST00000592099 4766 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 SCARA5-202ENST00000380385 2934 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 TOP3B-202ENST00000398793 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 NR3C1-204ENST00000394466 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 TCF4-276ENST00000635822 7805 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 AC010503.4-201ENST00000615487 688 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 USP2-AS1-202ENST00000500970 1784 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 AP002986.1-201ENST00000602376 1763 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 NLRP1-208ENST00000571451 5444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 DYNC1I2-204ENST00000409317 2196 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 DRAXIN-201ENST00000294485 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 DRD2-208ENST00000542968 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 DDX11-223ENST00000542838 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 DHX30-206ENST00000446256 3660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 PAPLN-208ENST00000555445 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 STK11IP-204ENST00000456909 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 GDPD5-202ENST00000443276 3106 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF564-201ENST00000339282 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 AGAP3-205ENST00000463381 2730 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF219-AS1-209ENST00000606429 2418 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 A1CF-203ENST00000373995 2211 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 PRTFDC1-201ENST00000320152 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 SMIM21-202ENST00000579022 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 SMG7-214ENST00000508461 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC25A25-205ENST00000432073 3678 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 MOCS1-204ENST00000373188 3358 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 TP53I11-203ENST00000395648 3381 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 AC010547.1-201ENST00000500612 2793 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 SP140L-203ENST00000415673 2665 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 AC021752.1-202ENST00000613161 2398 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 LITAF-203ENST00000413364 2292 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 ACTN2-201ENST00000366578 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 DDO-201ENST00000368923 1953 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 C9orf106-201ENST00000316786 3145 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 EMB-201ENST00000303221 4281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 KIAA1324-210ENST00000529753 2903 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 AL512791.2-201ENST00000615251 4609 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 TACC1-201ENST00000276520 6513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 PNPLA8-206ENST00000436062 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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