Protein–RNA interactions for Protein: Q96LB3

IFT74, Intraflagellar transport protein 74 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT74Q96LB3 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT74Q96LB3 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms