Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXT5

FOXD4L4, Forkhead box protein D4-like 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L4Q8WXT5 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 STXBP1-202ENST00000373302 3967 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 DPP8-204ENST00000358939 2822 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 PPP1R26P2-201ENST00000611403 3595 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXD4L4Q8WXT5 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXD4L4Q8WXT5 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXD4L4Q8WXT5 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXD4L4Q8WXT5 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXD4L4Q8WXT5 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXD4L4Q8WXT5 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXD4L4Q8WXT5 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXD4L4Q8WXT5 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXD4L4Q8WXT5 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXD4L4Q8WXT5 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXD4L4Q8WXT5 RASA4CP-203ENST00000446874 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXD4L4Q8WXT5 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXD4L4Q8WXT5 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXD4L4Q8WXT5 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXD4L4Q8WXT5 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXD4L4Q8WXT5 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD4L4Q8WXT5 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms