Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 QRICH1-204ENST00000424300 3009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 ZNF25-201ENST00000302609 4139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 CPT1C-203ENST00000392518 2910 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 FAM184A-211ENST00000521531 3244 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 GRIP2-206ENST00000637182 3727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 VASH2-203ENST00000366965 3572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 SLC26A8-202ENST00000394602 3144 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 ZSCAN5B-202ENST00000586855 2059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 CD27-AS1-209ENST00000545339 1766 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 HOPX-202ENST00000337881 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 POM121L7P-201ENST00000329949 2404 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 ERN2-201ENST00000256797 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 HSP90AA1-202ENST00000334701 3510 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 C19orf12-208ENST00000614091 4489 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 BTBD3-204ENST00000405977 5137 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
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CTF1Q16619 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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CTF1Q16619 TMED7-201ENST00000456936 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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CTF1Q16619 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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CTF1Q16619 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC12.57□□□□□ -0.4
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CTF1Q16619 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 CICP2-201ENST00000420675 2328 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 AC112176.1-201ENST00000565428 3024 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 EPB42-202ENST00000441366 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 GOLGA6L7P-201ENST00000567390 2397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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