Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASIC1P78348 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms