Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MCCD1P59942 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MCCD1P59942 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MCCD1P59942 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MCCD1P59942 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MCCD1P59942 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
MCCD1P59942 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MCCD1P59942 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MCCD1P59942 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MCCD1P59942 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MCCD1P59942 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCCD1P59942 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MCCD1P59942 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MCCD1P59942 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCCD1P59942 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCCD1P59942 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MCCD1P59942 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MCCD1P59942 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCCD1P59942 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MCCD1P59942 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCCD1P59942 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MCCD1P59942 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MCCD1P59942 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MCCD1P59942 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MCCD1P59942 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCCD1P59942 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MCCD1P59942 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MCCD1P59942 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCCD1P59942 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
MCCD1P59942 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCCD1P59942 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCCD1P59942 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCCD1P59942 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCCD1P59942 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MCCD1P59942 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MCCD1P59942 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MCCD1P59942 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
MCCD1P59942 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MCCD1P59942 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MCCD1P59942 AC068152.1-205ENST00000575173 1081 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MCCD1P59942 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MCCD1P59942 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MCCD1P59942 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCCD1P59942 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCCD1P59942 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCCD1P59942 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCCD1P59942 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MCCD1P59942 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCCD1P59942 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCCD1P59942 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCCD1P59942 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCCD1P59942 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MCCD1P59942 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCCD1P59942 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCCD1P59942 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MCCD1P59942 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MCCD1P59942 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
MCCD1P59942 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MCCD1P59942 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MCCD1P59942 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCCD1P59942 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MCCD1P59942 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MCCD1P59942 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MCCD1P59942 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MCCD1P59942 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MCCD1P59942 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC15.02■□□□□ -0
MCCD1P59942 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MCCD1P59942 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MCCD1P59942 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MCCD1P59942 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MCCD1P59942 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MCCD1P59942 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MCCD1P59942 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MCCD1P59942 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MCCD1P59942 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MCCD1P59942 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MCCD1P59942 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MCCD1P59942 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MCCD1P59942 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MCCD1P59942 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MCCD1P59942 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MCCD1P59942 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MCCD1P59942 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MCCD1P59942 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MCCD1P59942 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
MCCD1P59942 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MCCD1P59942 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MCCD1P59942 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
MCCD1P59942 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MCCD1P59942 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.02■□□□□ -0
MCCD1P59942 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MCCD1P59942 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
MCCD1P59942 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
MCCD1P59942 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
MCCD1P59942 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MCCD1P59942 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
MCCD1P59942 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.02■□□□□ -0
MCCD1P59942 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC15.02■□□□□ -0
MCCD1P59942 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
MCCD1P59942 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.8 ms