Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMTNP53814 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMTNP53814 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMTNP53814 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SMTNP53814 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SMTNP53814 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMTNP53814 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMTNP53814 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMTNP53814 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMTNP53814 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SMTNP53814 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMTNP53814 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMTNP53814 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMTNP53814 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMTNP53814 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMTNP53814 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMTNP53814 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMTNP53814 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMTNP53814 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMTNP53814 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMTNP53814 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMTNP53814 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMTNP53814 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMTNP53814 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMTNP53814 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMTNP53814 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMTNP53814 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMTNP53814 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SMTNP53814 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMTNP53814 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMTNP53814 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMTNP53814 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMTNP53814 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMTNP53814 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMTNP53814 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMTNP53814 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMTNP53814 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMTNP53814 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMTNP53814 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMTNP53814 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMTNP53814 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMTNP53814 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMTNP53814 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMTNP53814 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SMTNP53814 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMTNP53814 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMTNP53814 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SMTNP53814 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SMTNP53814 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMTNP53814 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMTNP53814 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SMTNP53814 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMTNP53814 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMTNP53814 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMTNP53814 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMTNP53814 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMTNP53814 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMTNP53814 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMTNP53814 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMTNP53814 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMTNP53814 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMTNP53814 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMTNP53814 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMTNP53814 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMTNP53814 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMTNP53814 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMTNP53814 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMTNP53814 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMTNP53814 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMTNP53814 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMTNP53814 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMTNP53814 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMTNP53814 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMTNP53814 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMTNP53814 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMTNP53814 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMTNP53814 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMTNP53814 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMTNP53814 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMTNP53814 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMTNP53814 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMTNP53814 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMTNP53814 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMTNP53814 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMTNP53814 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMTNP53814 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMTNP53814 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMTNP53814 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMTNP53814 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMTNP53814 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMTNP53814 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMTNP53814 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMTNP53814 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMTNP53814 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMTNP53814 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMTNP53814 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMTNP53814 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMTNP53814 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMTNP53814 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SMTNP53814 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms