Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms