Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 SLC26A6-204ENST00000383733 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 DACH2-201ENST00000373125 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 FLJ30679-201ENST00000624773 1980 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 OFD1-203ENST00000380567 3736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 MED24-204ENST00000394128 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 LAMTOR5-AS1-209ENST00000597455 805 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 SYNJ2-208ENST00000640338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 BAG6-247ENST00000439687 3104 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 DNMT3B-205ENST00000443239 2674 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 AL358933.1-201ENST00000565046 2830 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 KCNIP3-201ENST00000295225 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 SYTL4-201ENST00000263033 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 DNMT1-203ENST00000540357 4916 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 INPP5J-201ENST00000331075 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 CEACAM20-203ENST00000614924 1809 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms