Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CLIP4Q8N3C7 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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CLIP4Q8N3C7 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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CLIP4Q8N3C7 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
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CLIP4Q8N3C7 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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CLIP4Q8N3C7 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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CLIP4Q8N3C7 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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CLIP4Q8N3C7 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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CLIP4Q8N3C7 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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CLIP4Q8N3C7 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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CLIP4Q8N3C7 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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CLIP4Q8N3C7 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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