Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CGNL1Q0VF96 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CGNL1Q0VF96 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CGNL1Q0VF96 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CGNL1Q0VF96 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CGNL1Q0VF96 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CGNL1Q0VF96 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CGNL1Q0VF96 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CGNL1Q0VF96 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CGNL1Q0VF96 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CGNL1Q0VF96 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CGNL1Q0VF96 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CGNL1Q0VF96 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CGNL1Q0VF96 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CGNL1Q0VF96 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CGNL1Q0VF96 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CGNL1Q0VF96 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CGNL1Q0VF96 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CGNL1Q0VF96 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CGNL1Q0VF96 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CGNL1Q0VF96 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CGNL1Q0VF96 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CGNL1Q0VF96 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CGNL1Q0VF96 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CGNL1Q0VF96 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CGNL1Q0VF96 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CGNL1Q0VF96 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CGNL1Q0VF96 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CGNL1Q0VF96 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CGNL1Q0VF96 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms