Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms