Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GM2AP17900 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GM2AP17900 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GM2AP17900 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GM2AP17900 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GM2AP17900 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GM2AP17900 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GM2AP17900 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GM2AP17900 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GM2AP17900 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GM2AP17900 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GM2AP17900 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GM2AP17900 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GM2AP17900 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GM2AP17900 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GM2AP17900 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GM2AP17900 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GM2AP17900 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GM2AP17900 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GM2AP17900 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GM2AP17900 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GM2AP17900 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GM2AP17900 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GM2AP17900 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GM2AP17900 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GM2AP17900 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GM2AP17900 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GM2AP17900 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GM2AP17900 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GM2AP17900 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GM2AP17900 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GM2AP17900 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GM2AP17900 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GM2AP17900 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GM2AP17900 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GM2AP17900 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GM2AP17900 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GM2AP17900 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GM2AP17900 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GM2AP17900 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GM2AP17900 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GM2AP17900 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GM2AP17900 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GM2AP17900 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GM2AP17900 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GM2AP17900 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GM2AP17900 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GM2AP17900 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GM2AP17900 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GM2AP17900 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GM2AP17900 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GM2AP17900 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GM2AP17900 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GM2AP17900 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GM2AP17900 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GM2AP17900 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GM2AP17900 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GM2AP17900 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GM2AP17900 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GM2AP17900 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GM2AP17900 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GM2AP17900 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GM2AP17900 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GM2AP17900 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GM2AP17900 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GM2AP17900 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GM2AP17900 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GM2AP17900 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GM2AP17900 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GM2AP17900 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GM2AP17900 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GM2AP17900 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GM2AP17900 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GM2AP17900 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GM2AP17900 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GM2AP17900 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GM2AP17900 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GM2AP17900 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GM2AP17900 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GM2AP17900 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GM2AP17900 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GM2AP17900 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GM2AP17900 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GM2AP17900 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GM2AP17900 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GM2AP17900 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GM2AP17900 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GM2AP17900 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GM2AP17900 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GM2AP17900 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GM2AP17900 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GM2AP17900 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GM2AP17900 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GM2AP17900 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GM2AP17900 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GM2AP17900 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GM2AP17900 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GM2AP17900 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GM2AP17900 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GM2AP17900 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms