Protein–RNA interactions for Protein: P17480

UBTF, Nucleolar transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 764 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBTFP17480 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBTFP17480 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBTFP17480 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBTFP17480 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBTFP17480 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBTFP17480 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBTFP17480 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBTFP17480 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBTFP17480 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBTFP17480 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBTFP17480 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBTFP17480 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
UBTFP17480 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBTFP17480 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBTFP17480 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBTFP17480 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBTFP17480 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBTFP17480 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBTFP17480 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBTFP17480 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBTFP17480 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBTFP17480 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBTFP17480 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBTFP17480 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBTFP17480 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBTFP17480 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBTFP17480 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBTFP17480 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
UBTFP17480 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBTFP17480 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBTFP17480 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBTFP17480 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBTFP17480 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBTFP17480 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBTFP17480 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBTFP17480 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBTFP17480 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBTFP17480 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBTFP17480 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBTFP17480 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBTFP17480 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBTFP17480 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBTFP17480 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBTFP17480 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
UBTFP17480 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBTFP17480 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBTFP17480 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBTFP17480 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBTFP17480 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
UBTFP17480 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBTFP17480 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBTFP17480 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBTFP17480 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBTFP17480 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBTFP17480 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBTFP17480 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBTFP17480 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBTFP17480 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBTFP17480 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBTFP17480 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBTFP17480 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBTFP17480 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBTFP17480 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBTFP17480 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBTFP17480 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
UBTFP17480 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBTFP17480 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBTFP17480 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBTFP17480 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBTFP17480 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBTFP17480 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBTFP17480 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBTFP17480 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBTFP17480 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBTFP17480 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBTFP17480 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
UBTFP17480 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBTFP17480 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBTFP17480 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBTFP17480 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
UBTFP17480 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBTFP17480 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
UBTFP17480 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBTFP17480 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBTFP17480 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBTFP17480 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
UBTFP17480 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBTFP17480 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBTFP17480 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBTFP17480 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBTFP17480 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBTFP17480 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBTFP17480 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
UBTFP17480 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBTFP17480 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBTFP17480 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
UBTFP17480 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBTFP17480 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBTFP17480 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBTFP17480 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms