Protein–RNA interactions for Protein: P09496

CLTA, Clathrin light chain A, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTAP09496 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLTAP09496 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLTAP09496 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLTAP09496 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLTAP09496 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLTAP09496 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLTAP09496 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLTAP09496 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLTAP09496 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLTAP09496 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLTAP09496 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLTAP09496 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLTAP09496 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLTAP09496 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLTAP09496 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLTAP09496 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLTAP09496 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLTAP09496 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLTAP09496 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLTAP09496 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLTAP09496 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLTAP09496 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLTAP09496 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLTAP09496 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLTAP09496 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLTAP09496 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLTAP09496 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLTAP09496 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLTAP09496 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLTAP09496 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLTAP09496 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLTAP09496 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLTAP09496 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLTAP09496 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTAP09496 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTAP09496 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTAP09496 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTAP09496 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTAP09496 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTAP09496 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTAP09496 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTAP09496 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTAP09496 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTAP09496 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTAP09496 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTAP09496 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTAP09496 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTAP09496 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTAP09496 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTAP09496 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTAP09496 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTAP09496 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTAP09496 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTAP09496 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTAP09496 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTAP09496 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTAP09496 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTAP09496 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTAP09496 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTAP09496 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTAP09496 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTAP09496 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTAP09496 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTAP09496 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTAP09496 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTAP09496 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTAP09496 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTAP09496 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTAP09496 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTAP09496 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTAP09496 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTAP09496 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTAP09496 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTAP09496 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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CLTAP09496 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTAP09496 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTAP09496 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTAP09496 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTAP09496 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTAP09496 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTAP09496 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTAP09496 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTAP09496 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTAP09496 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTAP09496 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTAP09496 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTAP09496 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTAP09496 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTAP09496 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTAP09496 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTAP09496 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTAP09496 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTAP09496 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTAP09496 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTAP09496 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTAP09496 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTAP09496 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTAP09496 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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