Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 MIR2278-201ENST00000516344 96 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 ACY3-202ENST00000529256 933 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms