Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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USP35Q9P2H5 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
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USP35Q9P2H5 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
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