Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHP1Q99653 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHP1Q99653 DCAF5-209ENST00000557386 2883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHP1Q99653 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHP1Q99653 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHP1Q99653 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91 ms