Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms