Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 AC011489.1-201ENST00000586744 690 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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