Protein–RNA interactions for Protein: Q09428

ABCC8, ATP-binding cassette sub-family C member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC8Q09428 TPT1P6-201ENST00000458298 514 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCC8Q09428 AC093700.1-201ENST00000503348 717 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCC8Q09428 TGFBI-207ENST00000508076 1034 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCC8Q09428 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCC8Q09428 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCC8Q09428 CBR3-AS1-207ENST00000608641 777 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCC8Q09428 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCC8Q09428 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCC8Q09428 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCC8Q09428 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCC8Q09428 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCC8Q09428 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCC8Q09428 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCC8Q09428 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCC8Q09428 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCC8Q09428 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCC8Q09428 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCC8Q09428 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCC8Q09428 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCC8Q09428 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCC8Q09428 CASP8-206ENST00000392258 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCC8Q09428 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCC8Q09428 PSME2P2-201ENST00000453033 700 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCC8Q09428 RN7SL173P-201ENST00000461853 292 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCC8Q09428 MARK2P17-201ENST00000498560 841 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCC8Q09428 SMIM26-203ENST00000608034 670 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCC8Q09428 AL513478.2-202ENST00000621949 835 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCC8Q09428 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCC8Q09428 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCC8Q09428 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCC8Q09428 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 UBL7-206ENST00000565335 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 OR2T8-201ENST00000319968 939 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 OLA1P2-201ENST00000395519 1264 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 RN7SKP212-201ENST00000410851 328 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 PEBP1P3-201ENST00000455475 548 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 RNA5SP420-201ENST00000516997 137 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 CSAG3-201ENST00000599845 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 BX322562.1-201ENST00000617004 561 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 PAX6-237ENST00000638696 1203 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 CSAG2-203ENST00000638741 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 OR2T8-202ENST00000641945 1226 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 KRTAP12-2-201ENST00000360770 739 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 MYL4-202ENST00000393450 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 AC087442.1-201ENST00000525563 249 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 MBP-230ENST00000528160 584 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 NKAPP1-204ENST00000555168 557 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 AC009120.2-205ENST00000561921 490 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 AC020922.4-201ENST00000621389 339 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 AL353658.2-201ENST00000629794 519 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 TAC4-203ENST00000352793 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 AC068631.1-228ENST00000354642 742 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 AL513165.1-201ENST00000413915 289 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 DLGAP4-AS1-203ENST00000439595 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 AL137078.1-201ENST00000446280 404 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 PGAP2-207ENST00000463452 931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 CRYBB2P1-204ENST00000509460 701 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms