Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
GBE1Q04446 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms