Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 TKT-203ENST00000423525 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSCP56915 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GSCP56915 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GSCP56915 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSCP56915 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSCP56915 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSCP56915 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GSCP56915 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GSCP56915 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GSCP56915 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GSCP56915 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GSCP56915 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GSCP56915 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GSCP56915 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GSCP56915 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GSCP56915 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GSCP56915 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GSCP56915 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GSCP56915 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GSCP56915 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GSCP56915 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GSCP56915 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
GSCP56915 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GSCP56915 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GSCP56915 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
GSCP56915 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GSCP56915 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GSCP56915 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GSCP56915 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GSCP56915 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GSCP56915 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GSCP56915 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GSCP56915 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GSCP56915 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GSCP56915 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GSCP56915 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GSCP56915 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GSCP56915 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GSCP56915 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GSCP56915 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
GSCP56915 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GSCP56915 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GSCP56915 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GSCP56915 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GSCP56915 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GSCP56915 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GSCP56915 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GSCP56915 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GSCP56915 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GSCP56915 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GSCP56915 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GSCP56915 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GSCP56915 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GSCP56915 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GSCP56915 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GSCP56915 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GSCP56915 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GSCP56915 EPS15L1-202ENST00000455140 3266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GSCP56915 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GSCP56915 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GSCP56915 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GSCP56915 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GSCP56915 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GSCP56915 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GSCP56915 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GSCP56915 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GSCP56915 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GSCP56915 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GSCP56915 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GSCP56915 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GSCP56915 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GSCP56915 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GSCP56915 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GSCP56915 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GSCP56915 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GSCP56915 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GSCP56915 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
GSCP56915 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GSCP56915 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GSCP56915 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GSCP56915 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GSCP56915 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GSCP56915 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GSCP56915 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GSCP56915 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GSCP56915 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GSCP56915 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
GSCP56915 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GSCP56915 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GSCP56915 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
GSCP56915 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GSCP56915 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GSCP56915 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GSCP56915 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GSCP56915 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GSCP56915 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GSCP56915 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GSCP56915 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GSCP56915 ILF3-201ENST00000250241 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSCP56915 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms