Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 AKNA-202ENST00000307564 7380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 VAMP7-202ENST00000286448 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 KCNJ10-201ENST00000368089 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 SYMPK-201ENST00000245934 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 AL359915.2-202ENST00000440150 2469 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 PARD6B-201ENST00000371610 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 FARP1-201ENST00000319562 10262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 BEND6-202ENST00000370746 2379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 HDLBP-214ENST00000427183 6238 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 TAX1BP1-207ENST00000433216 3174 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 PPP6C-203ENST00000451402 4349 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 PCDHGA6-201ENST00000517434 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 PLA1A-206ENST00000495992 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 PLEC-202ENST00000345136 14803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 SLC8A3-205ENST00000394330 2622 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 PIGG-205ENST00000503111 2629 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 ITGA3-201ENST00000007722 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 NTNG1-206ENST00000370071 3149 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 PCSK2-202ENST00000377899 4674 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 KANK4-201ENST00000317477 2080 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 SETD1B-204ENST00000619791 5901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 SCN8A-209ENST00000627620 5943 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 SHPRH-202ENST00000367503 5237 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 RALGPS1-201ENST00000259351 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 DLGAP3-201ENST00000235180 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 SPTB-202ENST00000389720 6321 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 KLB-201ENST00000257408 6082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 SLC5A10-201ENST00000317977 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 VRK3-209ENST00000594948 1847 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 REXO5-208ENST00000564274 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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