Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL23P55773 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL23P55773 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL23P55773 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL23P55773 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL23P55773 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL23P55773 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL23P55773 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL23P55773 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL23P55773 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL23P55773 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL23P55773 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL23P55773 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL23P55773 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL23P55773 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL23P55773 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL23P55773 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL23P55773 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL23P55773 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL23P55773 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL23P55773 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL23P55773 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL23P55773 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL23P55773 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL23P55773 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL23P55773 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL23P55773 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL23P55773 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL23P55773 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL23P55773 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL23P55773 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL23P55773 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL23P55773 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL23P55773 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL23P55773 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL23P55773 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL23P55773 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL23P55773 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL23P55773 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL23P55773 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL23P55773 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL23P55773 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL23P55773 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL23P55773 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL23P55773 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL23P55773 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL23P55773 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL23P55773 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL23P55773 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL23P55773 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL23P55773 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL23P55773 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL23P55773 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL23P55773 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL23P55773 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL23P55773 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL23P55773 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL23P55773 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL23P55773 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL23P55773 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL23P55773 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL23P55773 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL23P55773 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL23P55773 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL23P55773 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL23P55773 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL23P55773 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL23P55773 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL23P55773 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL23P55773 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL23P55773 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL23P55773 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL23P55773 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL23P55773 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL23P55773 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL23P55773 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL23P55773 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL23P55773 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL23P55773 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL23P55773 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL23P55773 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL23P55773 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL23P55773 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL23P55773 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL23P55773 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL23P55773 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL23P55773 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL23P55773 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL23P55773 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL23P55773 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL23P55773 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL23P55773 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL23P55773 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL23P55773 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL23P55773 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL23P55773 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL23P55773 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL23P55773 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL23P55773 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL23P55773 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms