Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CASP9P55211 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CASP9P55211 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CASP9P55211 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CASP9P55211 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CASP9P55211 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CASP9P55211 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CASP9P55211 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CASP9P55211 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CASP9P55211 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CASP9P55211 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CASP9P55211 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CASP9P55211 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CASP9P55211 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CASP9P55211 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CASP9P55211 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CASP9P55211 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CASP9P55211 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CASP9P55211 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CASP9P55211 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CASP9P55211 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CASP9P55211 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CASP9P55211 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CASP9P55211 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CASP9P55211 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CASP9P55211 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CASP9P55211 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CASP9P55211 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CASP9P55211 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CASP9P55211 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CASP9P55211 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CASP9P55211 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CASP9P55211 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CASP9P55211 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CASP9P55211 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CASP9P55211 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CASP9P55211 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CASP9P55211 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CASP9P55211 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CASP9P55211 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CASP9P55211 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CASP9P55211 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CASP9P55211 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CASP9P55211 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CASP9P55211 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CASP9P55211 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CASP9P55211 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CASP9P55211 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CASP9P55211 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CASP9P55211 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CASP9P55211 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CASP9P55211 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CASP9P55211 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CASP9P55211 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CASP9P55211 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CASP9P55211 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CASP9P55211 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CASP9P55211 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CASP9P55211 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CASP9P55211 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CASP9P55211 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CASP9P55211 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CASP9P55211 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CASP9P55211 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CASP9P55211 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CASP9P55211 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CASP9P55211 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CASP9P55211 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CASP9P55211 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CASP9P55211 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CASP9P55211 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CASP9P55211 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CASP9P55211 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CASP9P55211 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CASP9P55211 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CASP9P55211 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CASP9P55211 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CASP9P55211 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CASP9P55211 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CASP9P55211 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CASP9P55211 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CASP9P55211 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CASP9P55211 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CASP9P55211 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CASP9P55211 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CASP9P55211 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CASP9P55211 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CASP9P55211 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CASP9P55211 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CASP9P55211 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CASP9P55211 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CASP9P55211 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CASP9P55211 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CASP9P55211 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CASP9P55211 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CASP9P55211 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CASP9P55211 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CASP9P55211 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CASP9P55211 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CASP9P55211 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms