Protein–RNA interactions for Protein: P53803

POLR2K, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2KP53803 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC10.1□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.1□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 IL10-202ENST00000423557 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 C2-209ENST00000452323 1999 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms