Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 CEP41-203ENST00000343969 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 RPS3AP53-201ENST00000454716 778 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 RN7SL488P-201ENST00000585186 286 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 AC130448.1-201ENST00000624179 1733 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 ACSM2B-201ENST00000329697 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 CD226-207ENST00000582621 1458 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 MRPL47-201ENST00000259038 1126 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 RSF1-IT1-201ENST00000528233 632 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 AC025419.1-202ENST00000535315 744 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 AC023158.1-201ENST00000561632 1025 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 AC079414.3-201ENST00000612986 1090 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 AL035425.4-201ENST00000624509 1063 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 ILF3-201ENST00000250241 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 AL132996.1-201ENST00000569865 1431 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 MCL1-204ENST00000620947 3626 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms