Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 TRPM1-210ENST00000559179 1002 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRXP46100 AC109597.2-201ENST00000569407 927 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRXP46100 RPL26-206ENST00000582556 763 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRXP46100 RN7SL322P-201ENST00000583519 299 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRXP46100 AC010319.4-201ENST00000593957 691 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRXP46100 MIR6871-201ENST00000613433 56 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRXP46100 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRXP46100 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRXP46100 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRXP46100 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRXP46100 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRXP46100 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
ATRXP46100 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
ATRXP46100 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
ATRXP46100 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
ATRXP46100 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
ATRXP46100 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRXP46100 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRXP46100 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRXP46100 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRXP46100 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRXP46100 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRXP46100 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRXP46100 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRXP46100 CSRP2-201ENST00000311083 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRXP46100 MKL1-204ENST00000402630 747 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRXP46100 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRXP46100 APRT-202ENST00000426324 664 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRXP46100 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRXP46100 HLA-DRB9-201ENST00000449413 343 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRXP46100 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRXP46100 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRXP46100 CSRP2-203ENST00000547435 632 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRXP46100 AC046168.2-202ENST00000561123 926 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRXP46100 AC009132.1-201ENST00000565194 320 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRXP46100 AL158032.2-201ENST00000616818 195 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRXP46100 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRXP46100 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRXP46100 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRXP46100 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRXP46100 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRXP46100 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRXP46100 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRXP46100 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRXP46100 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRXP46100 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRXP46100 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRXP46100 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRXP46100 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRXP46100 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRXP46100 CLUHP3-207ENST00000563678 1303 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRXP46100 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRXP46100 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRXP46100 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRXP46100 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRXP46100 MIR345-201ENST00000362114 98 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRXP46100 LSM2-208ENST00000375661 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRXP46100 RN7SL677P-201ENST00000466970 319 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRXP46100 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRXP46100 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRXP46100 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRXP46100 NAA60-236ENST00000577013 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRXP46100 MGST3-214ENST00000627653 1130 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRXP46100 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRXP46100 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRXP46100 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRXP46100 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRXP46100 SERHL2-201ENST00000327678 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRXP46100 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRXP46100 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRXP46100 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATRXP46100 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATRXP46100 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATRXP46100 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATRXP46100 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATRXP46100 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATRXP46100 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATRXP46100 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATRXP46100 WFDC2-203ENST00000342873 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATRXP46100 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATRXP46100 LCN12-202ENST00000371633 579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATRXP46100 AC245128.1-201ENST00000400864 1294 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATRXP46100 RFNG-202ENST00000429557 994 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATRXP46100 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATRXP46100 PLAC9P1-203ENST00000440031 223 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
ATRXP46100 AL359915.1-201ENST00000457719 898 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATRXP46100 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
ATRXP46100 AL133551.1-201ENST00000610279 1222 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
ATRXP46100 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATRXP46100 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATRXP46100 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATRXP46100 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATRXP46100 ELP4-223ENST00000640342 1392 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATRXP46100 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
ATRXP46100 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATRXP46100 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATRXP46100 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATRXP46100 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATRXP46100 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATRXP46100 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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