Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms