Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
OTX2P32243 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
OTX2P32243 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
OTX2P32243 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
OTX2P32243 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
OTX2P32243 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
OTX2P32243 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
OTX2P32243 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
OTX2P32243 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
OTX2P32243 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
OTX2P32243 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
OTX2P32243 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
OTX2P32243 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
OTX2P32243 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
OTX2P32243 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
OTX2P32243 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
OTX2P32243 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
OTX2P32243 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
OTX2P32243 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
OTX2P32243 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
OTX2P32243 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
OTX2P32243 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
OTX2P32243 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
OTX2P32243 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
OTX2P32243 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
OTX2P32243 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
OTX2P32243 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
OTX2P32243 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
OTX2P32243 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
OTX2P32243 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
OTX2P32243 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
OTX2P32243 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
OTX2P32243 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
OTX2P32243 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
OTX2P32243 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
OTX2P32243 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
OTX2P32243 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
OTX2P32243 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
OTX2P32243 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
OTX2P32243 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
OTX2P32243 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
OTX2P32243 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
OTX2P32243 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
OTX2P32243 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
OTX2P32243 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
OTX2P32243 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
OTX2P32243 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
OTX2P32243 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
OTX2P32243 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
OTX2P32243 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
OTX2P32243 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
OTX2P32243 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
OTX2P32243 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
OTX2P32243 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
OTX2P32243 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
OTX2P32243 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
OTX2P32243 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
OTX2P32243 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
OTX2P32243 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
OTX2P32243 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
OTX2P32243 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
OTX2P32243 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
OTX2P32243 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
OTX2P32243 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
OTX2P32243 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
OTX2P32243 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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OTX2P32243 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
OTX2P32243 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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OTX2P32243 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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OTX2P32243 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
OTX2P32243 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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OTX2P32243 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
OTX2P32243 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
OTX2P32243 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
OTX2P32243 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
OTX2P32243 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
OTX2P32243 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
OTX2P32243 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
OTX2P32243 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
OTX2P32243 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
OTX2P32243 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
OTX2P32243 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
OTX2P32243 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
OTX2P32243 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
OTX2P32243 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
OTX2P32243 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
OTX2P32243 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
OTX2P32243 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
OTX2P32243 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
OTX2P32243 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
OTX2P32243 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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