Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 PDE4DIP-237ENST00000585156 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 KRT17P7-202ENST00000582261 2334 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 DDB2-201ENST00000256996 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 GRPEL2-201ENST00000329271 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 STK24-201ENST00000376547 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 SLIT2-202ENST00000503823 5233 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 MCM4-215ENST00000523944 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 AC002550.1-201ENST00000565916 1379 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 FOSL2-202ENST00000379619 5829 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 VWDE-206ENST00000614403 4701 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 PARN-203ENST00000437198 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 PSMD2-205ENST00000435761 2574 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 PARG-207ENST00000616448 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 FP325332.1-201ENST00000624818 2045 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 H1FX-AS1-201ENST00000383461 2600 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 TMEM33-202ENST00000325094 6221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 NLGN3-205ENST00000536169 3863 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 NFATC4-209ENST00000553879 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 SPCS2-209ENST00000610881 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 VWDE-201ENST00000275358 5260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 AC124319.4-201ENST00000622931 2161 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 TLE3-220ENST00000559929 3408 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 PPP6R2-209ENST00000612753 4104 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 SLC13A2-202ENST00000444914 2855 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 HERC2P9-203ENST00000528584 2947 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 CD99L2-203ENST00000370377 3604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 EPB41L1-206ENST00000373950 3631 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 DIAPH2-203ENST00000373049 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 C9orf3-203ENST00000375315 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 ANXA11-202ENST00000372231 6720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 SEPT6-205ENST00000394610 4694 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 TMEM63B-201ENST00000259746 3318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 DPY19L1-201ENST00000310974 4870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 POLD1-205ENST00000595904 3402 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 THBS1-201ENST00000260356 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 DZIP1-201ENST00000347108 7068 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 SLC38A1-201ENST00000398637 8066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 ZNF286A-203ENST00000421016 5541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RAB4AP20338 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms