Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 SHANK2-203ENST00000409161 9208 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 CHFR-201ENST00000266880 11133 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC9.23□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 SDC3-201ENST00000336798 6392 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 F2RL3-201ENST00000248076 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC9.23□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC9.23□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 KCNMB1-201ENST00000274629 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 LINC01583-202ENST00000558082 2568 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 WTIP-202ENST00000590071 13665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 TBX3-201ENST00000257566 4208 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms