Protein–RNA interactions for Protein: O14908

GIPC1, PDZ domain-containing protein GIPC1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1O14908 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms