Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID3CA6NKF2 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID3CA6NKF2 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID3CA6NKF2 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID3CA6NKF2 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID3CA6NKF2 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID3CA6NKF2 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID3CA6NKF2 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID3CA6NKF2 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID3CA6NKF2 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID3CA6NKF2 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID3CA6NKF2 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID3CA6NKF2 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ARID3CA6NKF2 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ARID3CA6NKF2 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 BLOC1S1-202ENST00000548556 525 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 DPY19L2P4-201ENST00000479881 442 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms