Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms