Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KLHL42Q9P2K6 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KLHL42Q9P2K6 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KLHL42Q9P2K6 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KLHL42Q9P2K6 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 DDX27-201ENST00000371764 2643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 DNAL1-201ENST00000311089 2312 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL42Q9P2K6 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms