Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 IFT172-203ENST00000416524 1982 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 PAX8-203ENST00000348715 3966 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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TRIM5Q9C035 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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TRIM5Q9C035 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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TRIM5Q9C035 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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TRIM5Q9C035 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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TRIM5Q9C035 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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TRIM5Q9C035 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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