Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms