Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 AKAP13-201ENST00000361243 9468 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 CHD4-211ENST00000544484 6554 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 AC011481.3-201ENST00000623895 5594 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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RRN3P1Q2M238 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 TLK1-205ENST00000431350 5663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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RRN3P1Q2M238 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 LARP1-201ENST00000336314 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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RRN3P1Q2M238 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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RRN3P1Q2M238 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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RRN3P1Q2M238 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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RRN3P1Q2M238 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 COL19A1-205ENST00000620364 6233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 MECOM-206ENST00000464456 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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RRN3P1Q2M238 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 RIMS1-201ENST00000264839 7055 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 ASB7-201ENST00000332783 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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RRN3P1Q2M238 SMARCA2-209ENST00000382203 5867 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 LMCD1-201ENST00000157600 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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RRN3P1Q2M238 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 MTHFR-202ENST00000376583 7044 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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RRN3P1Q2M238 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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RRN3P1Q2M238 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
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