Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC10.91□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC10.91□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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FHL3Q13643 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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FHL3Q13643 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC10.9□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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FHL3Q13643 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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FHL3Q13643 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC10.9□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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FHL3Q13643 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC10.9□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.9□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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