Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 TTC23L-203ENST00000505624 1353 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 RXRG-201ENST00000359842 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 LPGAT1-201ENST00000366996 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 FTHL17-201ENST00000359202 813 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 AC004969.1-201ENST00000471553 578 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 GYG1-209ENST00000483267 801 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 GIMAP6-202ENST00000493969 876 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 AC114812.4-201ENST00000506676 757 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 AC122694.1-201ENST00000510987 563 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 AC022784.6-202ENST00000523246 674 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 AP002495.1-205ENST00000529513 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 AL445363.2-201ENST00000554608 837 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 AC007998.2-201ENST00000589258 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 LINC01588-216ENST00000623502 975 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 AL445363.1-201ENST00000623749 952 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 OR5L1-201ENST00000625203 1110 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 OAZ3-207ENST00000627780 850 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 OAZ3-209ENST00000635322 745 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 INCA1-201ENST00000355025 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 SLC25A5-201ENST00000317881 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 TXLNGY-202ENST00000407724 1000 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 RBMXP1-201ENST00000408004 1191 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 OR4C14P-201ENST00000440929 923 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 PLA2G15-203ENST00000444212 943 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 KCNC4-AS1-201ENST00000455967 748 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 AP000439.2-201ENST00000542064 726 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 RN7SL162P-201ENST00000579233 292 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 LINC00969-241ENST00000600527 852 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 AL080250.1-203ENST00000607799 747 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 CTRL-205ENST00000574481 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 CLEC10A-202ENST00000416562 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 EFHB-202ENST00000344838 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 IGLV3-9-201ENST00000390316 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 AC103563.2-201ENST00000442200 597 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 RPL35P1-201ENST00000450819 370 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 AL353653.1-201ENST00000452336 638 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 AC139493.2-202ENST00000510155 544 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 AC073896.3-201ENST00000546789 437 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 SULT1A3-206ENST00000563322 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 SULT1A4-204ENST00000565290 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 EEF1DP7-201ENST00000580496 513 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 MAFG-AS1-202ENST00000583492 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 AC138150.1-201ENST00000589950 570 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 STAMBP-204ENST00000409707 1649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 ECI2-207ENST00000465828 1548 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 SNRPN-205ENST00000400100 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 AKIP1-203ENST00000309377 1327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 TRIB1-203ENST00000520847 1332 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP7AQ04656 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms