Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms