Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SKOR1P84550 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SKOR1P84550 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SKOR1P84550 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SKOR1P84550 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SKOR1P84550 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SKOR1P84550 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SKOR1P84550 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SKOR1P84550 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SKOR1P84550 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SKOR1P84550 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SKOR1P84550 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SKOR1P84550 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SKOR1P84550 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SKOR1P84550 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SKOR1P84550 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SKOR1P84550 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SKOR1P84550 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SKOR1P84550 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SKOR1P84550 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SKOR1P84550 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SKOR1P84550 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SKOR1P84550 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SKOR1P84550 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SKOR1P84550 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SKOR1P84550 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SKOR1P84550 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SKOR1P84550 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SKOR1P84550 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SKOR1P84550 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SKOR1P84550 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SKOR1P84550 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SKOR1P84550 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SKOR1P84550 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SKOR1P84550 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SKOR1P84550 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SKOR1P84550 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SKOR1P84550 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SKOR1P84550 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SKOR1P84550 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SKOR1P84550 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
SKOR1P84550 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SKOR1P84550 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SKOR1P84550 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR1P84550 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR1P84550 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR1P84550 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR1P84550 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR1P84550 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR1P84550 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SKOR1P84550 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR1P84550 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR1P84550 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR1P84550 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR1P84550 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR1P84550 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR1P84550 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR1P84550 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR1P84550 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR1P84550 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR1P84550 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR1P84550 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR1P84550 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR1P84550 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR1P84550 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR1P84550 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR1P84550 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SKOR1P84550 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR1P84550 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR1P84550 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR1P84550 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR1P84550 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR1P84550 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SKOR1P84550 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR1P84550 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR1P84550 AL139317.3-201ENST00000555969 898 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR1P84550 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR1P84550 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR1P84550 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SKOR1P84550 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR1P84550 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR1P84550 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR1P84550 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR1P84550 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR1P84550 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR1P84550 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR1P84550 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR1P84550 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR1P84550 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR1P84550 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SKOR1P84550 MGA-212ENST00000619521 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR1P84550 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms